Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XylbQ3TNA1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms