Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca4Q3TKT4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca4Q3TKT4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms