Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp39Q3TIX9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp39Q3TIX9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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