Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa26Q3L180 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms