Protein–RNA interactions for Protein: Q31615

H2-T22, Histocompatibility 2, T region locus 22, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T22Q31615 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-T22Q31615 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms