Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms