Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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