Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim71Q1PSW8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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