Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klrb1Q0ZUP1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klrb1Q0ZUP1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms