Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gli2Q0VGT2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli2Q0VGT2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms