Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc39dQ0VF76 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms