Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms