Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrriq1Q0P5X1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrriq1Q0P5X1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms