Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TrioQ0KL02 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms