Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn2bQ0KL01 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn2bQ0KL01 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms