Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf541Q0GGX2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms