Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cass4Q08EC4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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