Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MitfQ08874 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MitfQ08874 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MitfQ08874 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms