Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Calb2Q08331 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Calb2Q08331 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms