Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf3Q07104 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms