Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms