Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col6a1Q04857 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col6a1Q04857 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms