Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms