Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms