Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms