Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ddr1Q03146 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms