Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnb1Q02248 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnb1Q02248 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms