Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RykQ01887 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RykQ01887 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RykQ01887 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms