Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VcpQ01853 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VcpQ01853 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms