Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxd1Q01822 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms