Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms