Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec23aQ01405 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms