Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms