Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms