Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Yy1Q00899 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Yy1Q00899 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Yy1Q00899 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Yy1Q00899 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Yy1Q00899 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms