Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms