Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GabpaQ00422 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms