Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pitx2P97474 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms