Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms