Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf1P84078 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms