Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1bP70700 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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