Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Usp9xP70398 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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Usp9xP70398 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Usp9xP70398 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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