Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms