Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NfixP70257 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfixP70257 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfixP70257 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfixP70257 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms