Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Plxna3P70208 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plxna3P70208 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms