Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf5P70191 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf5P70191 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms