Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
UbdP63072 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbdP63072 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbdP63072 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UbdP63072 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms