Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Snrpd3P62320 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms