Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ufm1P61961 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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