Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d1P61080 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d1P61080 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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